Defnyddir ystafelloedd glân fferyllol yn bennaf ar gyfer cynhyrchu eli, cyffuriau solet, suropau, setiau trwyth a fferyllol eraill.Mae cydymffurfio â safonau GMP ac ISO 14644 yn arfer cyffredin yn y diwydiant.Y prif nod yw sefydlu amgylchedd cynhyrchu di-haint gwyddonol a hynod gaeth, gan ganolbwyntio ar reolaeth fanwl gywir ar brosesau, gweithrediadau a systemau rheoli, a dileu'n llym unrhyw weithgaredd biolegol posibl, gronynnau llwch a chroeshalogi.Mae hyn er mwyn sicrhau cynhyrchu meddyginiaethau hylan o ansawdd uchel.Mae adolygiad trylwyr o'r amgylchedd cynhyrchu a rheolaethau amgylcheddol manwl yn hollbwysig.Argymhellir defnyddio technolegau arbed ynni lle bynnag y bo modd.Ar ôl i'r ystafell lân gymhwyso'n llawn, rhaid iddi gael cymeradwyaeth y Weinyddiaeth Bwyd a Chyffuriau leol cyn y gellir dechrau cynhyrchu.